Особливу цікавість представляють 4 частини парку, які є пам’ятниками природи загальнодержавного значення: Китайгородське оголення, печера Атлантида гіпсового походження довжиною 1,8 км, Смотричський каньйон і товтра Самовита. Унікальними геологічними пам’ятниками є заповідні урочища: Залучанська печера, товтра Першак з печерою, печера Малишка, скеля Голова велетня. Серед інших урочищ також варто відмітити живописну вапнякову гору Голова витязя, гору Теремець з аркою та карстовим мостиком над печерою.

На території парку багато джерел мінеральних вод типу „Нафтуся”, „Миргородська” і „Сатанівська”.

Адміністративно-культурним пам’ятником парку Подільські Товри є Кам’янець-Подільський, найбільш старовинна частина якого – Старе місто – була об’явлена історико-культурним заповідником. В його склад входять: Кам’янець-Подільська фортеця (XV-XVI), будівля міської ратуші (XIV), Домініканський (XIV) і Францисканський (XIV) монастирі, армянські бастіон, дзвіниця та торговий дім (XV-XVII), Петропавлівський кафедральний костел (XV-XVI), Петропавловська церква (1569), Турецький мінарет (XVII), монастир домініканок (1720-1722), Духовна семінарія (1790) та інші пам’ятники архітектури.

Національному природному парку Подільські Товтри відводиться особлива роль розвитку туризму. На його території діють і створюються нові туристичні маршрути: пішохідні та кінні, водні та лижні, автомобільні та велосипедні. До послуг туристів – туристичні бази та мотелі.